Protein–RNA interactions for Protein: Q330K2

NDUFAF6, NADH dehydrogenase (ubiquinone) complex I, assembly factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF6Q330K2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NDUFAF6Q330K2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDUFAF6Q330K2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NDUFAF6Q330K2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDUFAF6Q330K2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDUFAF6Q330K2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDUFAF6Q330K2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDUFAF6Q330K2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDUFAF6Q330K2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDUFAF6Q330K2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDUFAF6Q330K2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDUFAF6Q330K2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDUFAF6Q330K2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDUFAF6Q330K2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NDUFAF6Q330K2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDUFAF6Q330K2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDUFAF6Q330K2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDUFAF6Q330K2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDUFAF6Q330K2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDUFAF6Q330K2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDUFAF6Q330K2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDUFAF6Q330K2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDUFAF6Q330K2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDUFAF6Q330K2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDUFAF6Q330K2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDUFAF6Q330K2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NDUFAF6Q330K2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NDUFAF6Q330K2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NDUFAF6Q330K2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NDUFAF6Q330K2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDUFAF6Q330K2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDUFAF6Q330K2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDUFAF6Q330K2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDUFAF6Q330K2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDUFAF6Q330K2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDUFAF6Q330K2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDUFAF6Q330K2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NDUFAF6Q330K2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NDUFAF6Q330K2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NDUFAF6Q330K2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NDUFAF6Q330K2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NDUFAF6Q330K2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NDUFAF6Q330K2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NDUFAF6Q330K2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NDUFAF6Q330K2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDUFAF6Q330K2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDUFAF6Q330K2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NDUFAF6Q330K2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDUFAF6Q330K2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDUFAF6Q330K2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDUFAF6Q330K2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDUFAF6Q330K2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDUFAF6Q330K2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDUFAF6Q330K2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDUFAF6Q330K2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDUFAF6Q330K2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDUFAF6Q330K2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NDUFAF6Q330K2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NDUFAF6Q330K2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NDUFAF6Q330K2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NDUFAF6Q330K2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NDUFAF6Q330K2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NDUFAF6Q330K2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NDUFAF6Q330K2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NDUFAF6Q330K2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NDUFAF6Q330K2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NDUFAF6Q330K2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NDUFAF6Q330K2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NDUFAF6Q330K2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NDUFAF6Q330K2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDUFAF6Q330K2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDUFAF6Q330K2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDUFAF6Q330K2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDUFAF6Q330K2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NDUFAF6Q330K2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDUFAF6Q330K2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDUFAF6Q330K2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NDUFAF6Q330K2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NDUFAF6Q330K2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NDUFAF6Q330K2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NDUFAF6Q330K2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NDUFAF6Q330K2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NDUFAF6Q330K2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NDUFAF6Q330K2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NDUFAF6Q330K2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NDUFAF6Q330K2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NDUFAF6Q330K2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NDUFAF6Q330K2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NDUFAF6Q330K2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NDUFAF6Q330K2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NDUFAF6Q330K2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NDUFAF6Q330K2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NDUFAF6Q330K2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NDUFAF6Q330K2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NDUFAF6Q330K2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NDUFAF6Q330K2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NDUFAF6Q330K2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NDUFAF6Q330K2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NDUFAF6Q330K2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NDUFAF6Q330K2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms