Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q1T7F1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Q1T7F1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q1T7F1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q1T7F1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q1T7F1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q1T7F1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q1T7F1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q1T7F1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q1T7F1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q1T7F1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q1T7F1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q1T7F1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q1T7F1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q1T7F1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Q1T7F1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q1T7F1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q1T7F1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q1T7F1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q1T7F1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q1T7F1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q1T7F1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q1T7F1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q1T7F1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q1T7F1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q1T7F1 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q1T7F1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q1T7F1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q1T7F1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q1T7F1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Q1T7F1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q1T7F1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q1T7F1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q1T7F1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q1T7F1 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q1T7F1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Q1T7F1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q1T7F1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q1T7F1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q1T7F1 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q1T7F1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q1T7F1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q1T7F1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q1T7F1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q1T7F1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q1T7F1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q1T7F1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q1T7F1 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q1T7F1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q1T7F1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q1T7F1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q1T7F1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q1T7F1 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q1T7F1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q1T7F1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q1T7F1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q1T7F1 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q1T7F1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q1T7F1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q1T7F1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q1T7F1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q1T7F1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q1T7F1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q1T7F1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q1T7F1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q1T7F1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q1T7F1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q1T7F1 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q1T7F1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q1T7F1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q1T7F1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q1T7F1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q1T7F1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q1T7F1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Q1T7F1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Q1T7F1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q1T7F1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q1T7F1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q1T7F1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q1T7F1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q1T7F1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q1T7F1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Q1T7F1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Q1T7F1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q1T7F1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q1T7F1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q1T7F1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q1T7F1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q1T7F1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q1T7F1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q1T7F1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q1T7F1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q1T7F1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q1T7F1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q1T7F1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q1T7F1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q1T7F1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q1T7F1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q1T7F1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q1T7F1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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