Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RAB3GAP1Q15042 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RAB3GAP1Q15042 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RAB3GAP1Q15042 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RAB3GAP1Q15042 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RAB3GAP1Q15042 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RAB3GAP1Q15042 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
RAB3GAP1Q15042 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RAB3GAP1Q15042 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RAB3GAP1Q15042 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RAB3GAP1Q15042 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RAB3GAP1Q15042 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RAB3GAP1Q15042 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RAB3GAP1Q15042 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
RAB3GAP1Q15042 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RAB3GAP1Q15042 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
RAB3GAP1Q15042 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
RAB3GAP1Q15042 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RAB3GAP1Q15042 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RAB3GAP1Q15042 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RAB3GAP1Q15042 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RAB3GAP1Q15042 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RAB3GAP1Q15042 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
RAB3GAP1Q15042 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RAB3GAP1Q15042 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
RAB3GAP1Q15042 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RAB3GAP1Q15042 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RAB3GAP1Q15042 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RAB3GAP1Q15042 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RAB3GAP1Q15042 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RAB3GAP1Q15042 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RAB3GAP1Q15042 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RAB3GAP1Q15042 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RAB3GAP1Q15042 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RAB3GAP1Q15042 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RAB3GAP1Q15042 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RAB3GAP1Q15042 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RAB3GAP1Q15042 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RAB3GAP1Q15042 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RAB3GAP1Q15042 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RAB3GAP1Q15042 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RAB3GAP1Q15042 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RAB3GAP1Q15042 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RAB3GAP1Q15042 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RAB3GAP1Q15042 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RAB3GAP1Q15042 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RAB3GAP1Q15042 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RAB3GAP1Q15042 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RAB3GAP1Q15042 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RAB3GAP1Q15042 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RAB3GAP1Q15042 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RAB3GAP1Q15042 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RAB3GAP1Q15042 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RAB3GAP1Q15042 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RAB3GAP1Q15042 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RAB3GAP1Q15042 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RAB3GAP1Q15042 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RAB3GAP1Q15042 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RAB3GAP1Q15042 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
RAB3GAP1Q15042 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RAB3GAP1Q15042 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
RAB3GAP1Q15042 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RAB3GAP1Q15042 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RAB3GAP1Q15042 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RAB3GAP1Q15042 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
RAB3GAP1Q15042 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
RAB3GAP1Q15042 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RAB3GAP1Q15042 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RAB3GAP1Q15042 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RAB3GAP1Q15042 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RAB3GAP1Q15042 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RAB3GAP1Q15042 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RAB3GAP1Q15042 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RAB3GAP1Q15042 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RAB3GAP1Q15042 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RAB3GAP1Q15042 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RAB3GAP1Q15042 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RAB3GAP1Q15042 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RAB3GAP1Q15042 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RAB3GAP1Q15042 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RAB3GAP1Q15042 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RAB3GAP1Q15042 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RAB3GAP1Q15042 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RAB3GAP1Q15042 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RAB3GAP1Q15042 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RAB3GAP1Q15042 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RAB3GAP1Q15042 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RAB3GAP1Q15042 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RAB3GAP1Q15042 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RAB3GAP1Q15042 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RAB3GAP1Q15042 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RAB3GAP1Q15042 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RAB3GAP1Q15042 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RAB3GAP1Q15042 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RAB3GAP1Q15042 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
RAB3GAP1Q15042 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RAB3GAP1Q15042 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
RAB3GAP1Q15042 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RAB3GAP1Q15042 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RAB3GAP1Q15042 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms