Protein–RNA interactions for Protein: Q12378

RTR2, RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RTR2, yeastyeast

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTR2Q12378 YDR396WYDR396W 501 nt5.34□□□□□ -1.55
RTR2Q12378 BCY1YIL033C 1251 nt5.34□□□□□ -1.55
RTR2Q12378 YLR317WYLR317W 435 nt5.34□□□□□ -1.55
RTR2Q12378 RHO2YNL090W 579 nt5.34□□□□□ -1.55
RTR2Q12378 HSF1YGL073W 2502 nt5.34□□□□□ -1.56
RTR2Q12378 DSF1YEL070W 1509 nt5.33□□□□□ -1.56
RTR2Q12378 YNR073CYNR073C 1509 nt5.33□□□□□ -1.56
RTR2Q12378 DBF4YDR052C 2115 nt5.33□□□□□ -1.56
RTR2Q12378 SIP5YMR140W 1470 nt5.33□□□□□ -1.56
RTR2Q12378 YER148W-AYER148W-A 579 nt5.33□□□□□ -1.56
RTR2Q12378 PRE3YJL001W 648 nt5.33□□□□□ -1.56
RTR2Q12378 SRL2YLR082C 1179 nt5.33□□□□□ -1.56
RTR2Q12378 RAD53YPL153C 2466 nt5.33□□□□□ -1.56
RTR2Q12378 PTC3YBL056W 1407 nt5.32□□□□□ -1.56
RTR2Q12378 UGX2YDL169C 672 nt5.32□□□□□ -1.56
RTR2Q12378 YEL077CYEL077C 3834 nt5.32□□□□□ -1.56
RTR2Q12378 PHM8YER037W 966 nt5.32□□□□□ -1.56
RTR2Q12378 VPS24YKL041W 675 nt5.32□□□□□ -1.56
RTR2Q12378 YJU3YKL094W 942 nt5.32□□□□□ -1.56
RTR2Q12378 ZRT2YLR130C 1269 nt5.32□□□□□ -1.56
RTR2Q12378 NRM1YNR009W 750 nt5.32□□□□□ -1.56
RTR2Q12378 CYK3YDL117W 2658 nt5.32□□□□□ -1.56
RTR2Q12378 OCA5YHL029C 2040 nt5.31□□□□□ -1.56
RTR2Q12378 HVG1YER039C 750 nt5.31□□□□□ -1.56
RTR2Q12378 EHD3YDR036C 1503 nt5.31□□□□□ -1.56
RTR2Q12378 ERG1YGR175C 1491 nt5.31□□□□□ -1.56
RTR2Q12378 AMD2YDR242W 1650 nt5.31□□□□□ -1.56
RTR2Q12378 EXO1YOR033C 2109 nt5.3□□□□□ -1.56
RTR2Q12378 DUR1,2YBR208C 5508 nt5.3□□□□□ -1.56
RTR2Q12378 PPT1YGR123C 1542 nt5.3□□□□□ -1.56
RTR2Q12378 YME1YPR024W 2244 nt5.3□□□□□ -1.56
RTR2Q12378 HPF1YOL155C 2904 nt5.3□□□□□ -1.56
RTR2Q12378 SGV1YPR161C 1974 nt5.3□□□□□ -1.56
RTR2Q12378 HOR7YMR251W-A 180 nt5.3□□□□□ -1.56
RTR2Q12378 GTO3YMR251W 1101 nt5.3□□□□□ -1.56
RTR2Q12378 IDP3YNL009W 1263 nt5.3□□□□□ -1.56
RTR2Q12378 PTC4YBR125C 1182 nt5.3□□□□□ -1.56
RTR2Q12378 SSK1YLR006C 2139 nt5.3□□□□□ -1.56
RTR2Q12378 VRP1YLR337C 2454 nt5.3□□□□□ -1.56
RTR2Q12378 RPT2YDL007W 1314 nt5.29□□□□□ -1.56
RTR2Q12378 NRD1YNL251C 1728 nt5.29□□□□□ -1.56
RTR2Q12378 SOH1YGL127C 384 nt5.29□□□□□ -1.56
RTR2Q12378 HAP2YGL237C 798 nt5.29□□□□□ -1.56
RTR2Q12378 YHL018WYHL018W 363 nt5.29□□□□□ -1.56
RTR2Q12378 DBP8YHR169W 1296 nt5.29□□□□□ -1.56
RTR2Q12378 ASK1YKL052C 879 nt5.29□□□□□ -1.56
RTR2Q12378 YNL019CYNL019C 855 nt5.29□□□□□ -1.56
RTR2Q12378 YNL033WYNL033W 855 nt5.29□□□□□ -1.56
RTR2Q12378 RVB2YPL235W 1416 nt5.29□□□□□ -1.56
RTR2Q12378 HST3YOR025W 1344 nt5.28□□□□□ -1.56
RTR2Q12378 HEM3YDL205C 984 nt5.28□□□□□ -1.56
RTR2Q12378 YER186CYER186C 921 nt5.28□□□□□ -1.56
RTR2Q12378 FPR3YML074C 1236 nt5.28□□□□□ -1.56
RTR2Q12378 FRE3YOR381W 2136 nt5.28□□□□□ -1.56
RTR2Q12378 ECM33YBR078W 1290 nt5.28□□□□□ -1.56
RTR2Q12378 QDR3YBR043C 2070 nt5.28□□□□□ -1.56
RTR2Q12378 RPS2YGL123W 765 nt5.27□□□□□ -1.57
RTR2Q12378 MOG1YJR074W 657 nt5.27□□□□□ -1.57
RTR2Q12378 YJR084WYJR084W 1272 nt5.27□□□□□ -1.57
RTR2Q12378 SFC1YJR095W 969 nt5.27□□□□□ -1.57
RTR2Q12378 YML012C-AYML012C-A 378 nt5.27□□□□□ -1.57
RTR2Q12378 YPK2YMR104C 2034 nt5.27□□□□□ -1.57
RTR2Q12378 PSH1YOL054W 1221 nt5.27□□□□□ -1.57
RTR2Q12378 CHL4YDR254W 1377 nt5.27□□□□□ -1.57
RTR2Q12378 LYS21YDL131W 1323 nt5.26□□□□□ -1.57
RTR2Q12378 ILV1YER086W 1731 nt5.26□□□□□ -1.57
RTR2Q12378 RAD59YDL059C 717 nt5.26□□□□□ -1.57
RTR2Q12378 RME1YGR044C 903 nt5.26□□□□□ -1.57
RTR2Q12378 MPM1YJL066C 759 nt5.26□□□□□ -1.57
RTR2Q12378 YKL031WYKL031W 414 nt5.26□□□□□ -1.57
RTR2Q12378 AAT2YLR027C 1257 nt5.26□□□□□ -1.57
RTR2Q12378 SPG4YMR107W 348 nt5.26□□□□□ -1.57
RTR2Q12378 YNL108CYNL108C 813 nt5.26□□□□□ -1.57
RTR2Q12378 ENV9YOR246C 993 nt5.26□□□□□ -1.57
RTR2Q12378 COX11YPL132W 903 nt5.26□□□□□ -1.57
RTR2Q12378 PKC1YBL105C 3456 nt5.26□□□□□ -1.57
RTR2Q12378 WHI2YOR043W 1461 nt5.26□□□□□ -1.57
RTR2Q12378 NTH2YBR001C 2343 nt5.25□□□□□ -1.57
RTR2Q12378 BUG1YDL099W 1026 nt5.25□□□□□ -1.57
RTR2Q12378 VAM7YGL212W 951 nt5.25□□□□□ -1.57
RTR2Q12378 GLC8YMR311C 690 nt5.25□□□□□ -1.57
RTR2Q12378 MDY2YOL111C 639 nt5.25□□□□□ -1.57
RTR2Q12378 GYP1YOR070C 1914 nt5.25□□□□□ -1.57
RTR2Q12378 ICL1YER065C 1674 nt5.24□□□□□ -1.57
RTR2Q12378 CRF1YDR223W 1404 nt5.24□□□□□ -1.57
RTR2Q12378 SDH4YDR178W 546 nt5.24□□□□□ -1.57
RTR2Q12378 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt5.24□□□□□ -1.57
RTR2Q12378 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt5.24□□□□□ -1.57
RTR2Q12378 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt5.24□□□□□ -1.57
RTR2Q12378 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt5.24□□□□□ -1.57
RTR2Q12378 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt5.24□□□□□ -1.57
RTR2Q12378 YPR098CYPR098C 486 nt5.24□□□□□ -1.57
RTR2Q12378 MSN2YMR037C 2115 nt5.24□□□□□ -1.57
RTR2Q12378 PMT2YAL023C 2280 nt5.23□□□□□ -1.57
RTR2Q12378 CCZ1YBR131W 2115 nt5.23□□□□□ -1.57
RTR2Q12378 MCM3YEL032W 2916 nt5.23□□□□□ -1.57
RTR2Q12378 MRPL15YLR312W-A 762 nt5.23□□□□□ -1.57
RTR2Q12378 PDR16YNL231C 1056 nt5.23□□□□□ -1.57
RTR2Q12378 UIP4YPL186C 915 nt5.23□□□□□ -1.57
RTR2Q12378 JIP4YDR475C 2631 nt5.22□□□□□ -1.57
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