Protein–RNA interactions for Protein: Q12250

RPN5, 26S proteasome regulatory subunit RPN5, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPN5Q12250 YDR514CYDR514C 1452 nt5.77□□□□□ -1.49
RPN5Q12250 GPT2YKR067W 2232 nt5.76□□□□□ -1.49
RPN5Q12250 SUB2YDL084W 1341 nt5.76□□□□□ -1.49
RPN5Q12250 FET3YMR058W 1911 nt5.76□□□□□ -1.49
RPN5Q12250 STE13YOR219C 2796 nt5.76□□□□□ -1.49
RPN5Q12250 SUP2tY(GUA)D 75 nt5.76□□□□□ -1.49
RPN5Q12250 SUP11tY(GUA)F1 75 nt5.76□□□□□ -1.49
RPN5Q12250 SUP6tY(GUA)F2 75 nt5.76□□□□□ -1.49
RPN5Q12250 SUP7tY(GUA)J1 75 nt5.76□□□□□ -1.49
RPN5Q12250 SUP4tY(GUA)J2 75 nt5.76□□□□□ -1.49
RPN5Q12250 SUP5tY(GUA)M1 75 nt5.76□□□□□ -1.49
RPN5Q12250 SUP8tY(GUA)M2 75 nt5.76□□□□□ -1.49
RPN5Q12250 SUP3tY(GUA)O 75 nt5.76□□□□□ -1.49
RPN5Q12250 HSP150YJL159W 1242 nt5.76□□□□□ -1.49
RPN5Q12250 YNR040WYNR040W 771 nt5.76□□□□□ -1.49
RPN5Q12250 HOS1YPR068C 1413 nt5.75□□□□□ -1.49
RPN5Q12250 YDL129WYDL129W 876 nt5.75□□□□□ -1.49
RPN5Q12250 TIM22YDL217C 624 nt5.75□□□□□ -1.49
RPN5Q12250 FYV1YDR024W 486 nt5.75□□□□□ -1.49
RPN5Q12250 YNL108CYNL108C 813 nt5.75□□□□□ -1.49
RPN5Q12250 RPN7YPR108W 1290 nt5.75□□□□□ -1.49
RPN5Q12250 SSK1YLR006C 2139 nt5.74□□□□□ -1.49
RPN5Q12250 RPN11YFR004W 921 nt5.74□□□□□ -1.49
RPN5Q12250 YLR184WYLR184W 348 nt5.74□□□□□ -1.49
RPN5Q12250 QRI5YLR204W 336 nt5.74□□□□□ -1.49
RPN5Q12250 JNM1YMR294W 1122 nt5.74□□□□□ -1.49
RPN5Q12250 YNL097W-AYNL097W-A 156 nt5.74□□□□□ -1.49
RPN5Q12250 FSF1YOR271C 984 nt5.74□□□□□ -1.49
RPN5Q12250 PEX32YBR168W 1242 nt5.74□□□□□ -1.49
RPN5Q12250 ACC1YNR016C 6702 nt5.74□□□□□ -1.49
RPN5Q12250 KEL1YHR158C 3495 nt5.73□□□□□ -1.49
RPN5Q12250 CDC10YCR002C 969 nt5.73□□□□□ -1.49
RPN5Q12250 ERP5YHR110W 639 nt5.73□□□□□ -1.49
RPN5Q12250 EFM3YJR129C 1020 nt5.73□□□□□ -1.49
RPN5Q12250 YLR157W-EYLR157W-E 165 nt5.73□□□□□ -1.49
RPN5Q12250 YBR124WYBR124W 360 nt5.73□□□□□ -1.49
RPN5Q12250 ATG4YNL223W 1485 nt5.72□□□□□ -1.49
RPN5Q12250 TRP1YDR007W 675 nt5.72□□□□□ -1.49
RPN5Q12250 GAL83YER027C 1254 nt5.72□□□□□ -1.49
RPN5Q12250 LEU5YHR002W 1074 nt5.72□□□□□ -1.49
RPN5Q12250 ARP1YHR129C 1155 nt5.72□□□□□ -1.49
RPN5Q12250 POR2YIL114C 846 nt5.72□□□□□ -1.49
RPN5Q12250 RPE1YJL121C 717 nt5.72□□□□□ -1.49
RPN5Q12250 RPS5YJR123W 678 nt5.72□□□□□ -1.49
RPN5Q12250 HAP3YBL021C 435 nt5.72□□□□□ -1.49
RPN5Q12250 SEC17YBL050W 879 nt5.72□□□□□ -1.49
RPN5Q12250 ESC8YOL017W 2145 nt5.72□□□□□ -1.49
RPN5Q12250 TKL1YPR074C 2043 nt5.72□□□□□ -1.49
RPN5Q12250 VPS4YPR173C 1314 nt5.72□□□□□ -1.49
RPN5Q12250 RAD24YER173W 1980 nt5.71□□□□□ -1.49
RPN5Q12250 OAC1YKL120W 975 nt5.71□□□□□ -1.5
RPN5Q12250 YMR135W-AYMR135W-A 534 nt5.71□□□□□ -1.5
RPN5Q12250 FOB1YDR110W 1701 nt5.71□□□□□ -1.5
RPN5Q12250 IMD1YAR073W 1212 nt5.7□□□□□ -1.5
RPN5Q12250 MRP51YPL118W 1035 nt5.7□□□□□ -1.5
RPN5Q12250 HAL1YPR005C 885 nt5.7□□□□□ -1.5
RPN5Q12250 TEL2YGR099W 2067 nt5.7□□□□□ -1.5
RPN5Q12250 RCK1YGL158W 1539 nt5.69□□□□□ -1.5
RPN5Q12250 HAS1YMR290C 1518 nt5.69□□□□□ -1.5
RPN5Q12250 RAD3YER171W 2337 nt5.69□□□□□ -1.5
RPN5Q12250 VPS5YOR069W 2028 nt5.69□□□□□ -1.5
RPN5Q12250 RPL7AYGL076C 735 nt5.69□□□□□ -1.5
RPN5Q12250 HAP2YGL237C 798 nt5.69□□□□□ -1.5
RPN5Q12250 YNL042W-BYNL042W-B 258 nt5.69□□□□□ -1.5
RPN5Q12250 RPL7BYPL198W 735 nt5.69□□□□□ -1.5
RPN5Q12250 RBA50YDR527W 1320 nt5.69□□□□□ -1.5
RPN5Q12250 AFG1YEL052W 1530 nt5.69□□□□□ -1.5
RPN5Q12250 RPR2YIR015W 435 nt5.68□□□□□ -1.5
RPN5Q12250 PYK2YOR347C 1521 nt5.68□□□□□ -1.5
RPN5Q12250 UTP4YDR324C 2331 nt5.68□□□□□ -1.5
RPN5Q12250 GPB2YAL056W 2643 nt5.67□□□□□ -1.5
RPN5Q12250 GEX1YCL073C 1848 nt5.67□□□□□ -1.5
RPN5Q12250 NOP2YNL061W 1857 nt5.67□□□□□ -1.5
RPN5Q12250 SUP19tS(UGA)E 82 nt5.67□□□□□ -1.5
RPN5Q12250 SUP17tS(UGA)I 82 nt5.67□□□□□ -1.5
RPN5Q12250 SUP16tS(UGA)P 82 nt5.67□□□□□ -1.5
RPN5Q12250 GCV3YAL044C 513 nt5.67□□□□□ -1.5
RPN5Q12250 RPS28AYOR167C 204 nt5.67□□□□□ -1.5
RPN5Q12250 YPR160C-AYPR160C-A 285 nt5.67□□□□□ -1.5
RPN5Q12250 XBP1YIL101C 1944 nt5.67□□□□□ -1.5
RPN5Q12250 GIT1YCR098C 1557 nt5.67□□□□□ -1.5
RPN5Q12250 CRZ1YNL027W 2037 nt5.67□□□□□ -1.5
RPN5Q12250 PTR2YKR093W 1806 nt5.67□□□□□ -1.5
RPN5Q12250 PEX7YDR142C 1128 nt5.66□□□□□ -1.5
RPN5Q12250 DOT5YIL010W 648 nt5.66□□□□□ -1.5
RPN5Q12250 ODC2YOR222W 924 nt5.66□□□□□ -1.5
RPN5Q12250 GUP2YPL189W 1830 nt5.66□□□□□ -1.5
RPN5Q12250 MCM3YEL032W 2916 nt5.66□□□□□ -1.5
RPN5Q12250 MET7YOR241W 1647 nt5.66□□□□□ -1.5
RPN5Q12250 QRI1YDL103C 1434 nt5.65□□□□□ -1.5
RPN5Q12250 SKS1YPL026C 1509 nt5.65□□□□□ -1.5
RPN5Q12250 PRI2YKL045W 1587 nt5.65□□□□□ -1.5
RPN5Q12250 STB5YHR178W 2232 nt5.65□□□□□ -1.5
RPN5Q12250 MPM1YJL066C 759 nt5.65□□□□□ -1.5
RPN5Q12250 YJU3YKL094W 942 nt5.65□□□□□ -1.5
RPN5Q12250 ZRT2YLR130C 1269 nt5.65□□□□□ -1.5
RPN5Q12250 VMA4YOR332W 702 nt5.65□□□□□ -1.5
RPN5Q12250 CWC27YPL064C 906 nt5.65□□□□□ -1.5
RPN5Q12250 YPK2YMR104C 2034 nt5.65□□□□□ -1.51
RPN5Q12250 YLH47YPR125W 1365 nt5.65□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.4 ms