Protein–RNA interactions for Protein: Q12010

YPQ1, Probable vacuolar amino acid transporter YPQ1, yeastyeast

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPQ1Q12010 HAP2YGL237C 798 nt5.77□□□□□ -1.49
YPQ1Q12010 HSX1tR(CCU)J 72 nt5.77□□□□□ -1.49
YPQ1Q12010 ERG3YLR056W 1098 nt5.77□□□□□ -1.49
YPQ1Q12010 HSP26YBR072W 645 nt5.77□□□□□ -1.49
YPQ1Q12010 YCL041CYCL041C 495 nt5.77□□□□□ -1.49
YPQ1Q12010 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt5.76□□□□□ -1.49
YPQ1Q12010 PGU1YJR153W 1086 nt5.76□□□□□ -1.49
YPQ1Q12010 YML083CYML083C 1257 nt5.76□□□□□ -1.49
YPQ1Q12010 YOL163WYOL163W 510 nt5.76□□□□□ -1.49
YPQ1Q12010 PKC1YBL105C 3456 nt5.76□□□□□ -1.49
YPQ1Q12010 YER010CYER010C 705 nt5.75□□□□□ -1.49
YPQ1Q12010 YLR118CYLR118C 684 nt5.75□□□□□ -1.49
YPQ1Q12010 SSO1YPL232W 873 nt5.75□□□□□ -1.49
YPQ1Q12010 YFL052WYFL052W 1398 nt5.75□□□□□ -1.49
YPQ1Q12010 DAL4YIR028W 1908 nt5.75□□□□□ -1.49
YPQ1Q12010 MNN5YJL186W 1761 nt5.75□□□□□ -1.49
YPQ1Q12010 TIM54YJL054W 1437 nt5.74□□□□□ -1.49
YPQ1Q12010 MKK1YOR231W 1527 nt5.74□□□□□ -1.49
YPQ1Q12010 RME1YGR044C 903 nt5.74□□□□□ -1.49
YPQ1Q12010 ICS3YJL077C 396 nt5.74□□□□□ -1.49
YPQ1Q12010 HMS2YJR147W 1077 nt5.74□□□□□ -1.49
YPQ1Q12010 CMR1YDL156W 1569 nt5.73□□□□□ -1.49
YPQ1Q12010 YHL017WYHL017W 1599 nt5.73□□□□□ -1.49
YPQ1Q12010 RTT106YNL206C 1368 nt5.73□□□□□ -1.49
YPQ1Q12010 PRM10YJL108C 1152 nt5.73□□□□□ -1.49
YPQ1Q12010 YUR1YJL139C 1287 nt5.73□□□□□ -1.49
YPQ1Q12010 YJR115WYJR115W 510 nt5.73□□□□□ -1.49
YPQ1Q12010 YKL151CYKL151C 1014 nt5.73□□□□□ -1.49
YPQ1Q12010 YPK2YMR104C 2034 nt5.73□□□□□ -1.49
YPQ1Q12010 NUD1YOR373W 2556 nt5.73□□□□□ -1.49
YPQ1Q12010 DIA3YDL024C 1407 nt5.73□□□□□ -1.49
YPQ1Q12010 ELP3YPL086C 1674 nt5.72□□□□□ -1.49
YPQ1Q12010 COX26YDR119W-A 201 nt5.72□□□□□ -1.49
YPQ1Q12010 YGL194C-AYGL194C-A 243 nt5.72□□□□□ -1.49
YPQ1Q12010 ECM30YLR436C 3825 nt5.72□□□□□ -1.49
YPQ1Q12010 YME1YPR024W 2244 nt5.72□□□□□ -1.49
YPQ1Q12010 GAA1YLR088W 1845 nt5.71□□□□□ -1.49
YPQ1Q12010 TFC6YDR362C 2019 nt5.71□□□□□ -1.5
YPQ1Q12010 RPS2YGL123W 765 nt5.71□□□□□ -1.5
YPQ1Q12010 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt5.71□□□□□ -1.5
YPQ1Q12010 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt5.71□□□□□ -1.5
YPQ1Q12010 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt5.71□□□□□ -1.5
YPQ1Q12010 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt5.71□□□□□ -1.5
YPQ1Q12010 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt5.71□□□□□ -1.5
YPQ1Q12010 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt5.71□□□□□ -1.5
YPQ1Q12010 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt5.71□□□□□ -1.5
YPQ1Q12010 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt5.71□□□□□ -1.5
YPQ1Q12010 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt5.71□□□□□ -1.5
YPQ1Q12010 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt5.71□□□□□ -1.5
YPQ1Q12010 YGR182CYGR182C 354 nt5.71□□□□□ -1.5
YPQ1Q12010 STM1YLR150W 822 nt5.71□□□□□ -1.5
YPQ1Q12010 YLR283WYLR283W 945 nt5.71□□□□□ -1.5
YPQ1Q12010 PIN2YOR104W 849 nt5.71□□□□□ -1.5
YPQ1Q12010 YTH1YPR107C 627 nt5.71□□□□□ -1.5
YPQ1Q12010 RPN7YPR108W 1290 nt5.71□□□□□ -1.5
YPQ1Q12010 PFK2YMR205C 2880 nt5.7□□□□□ -1.5
YPQ1Q12010 YDL034WYDL034W 345 nt5.7□□□□□ -1.5
YPQ1Q12010 GPI11YDR302W 660 nt5.7□□□□□ -1.5
YPQ1Q12010 CAD1YDR423C 1230 nt5.7□□□□□ -1.5
YPQ1Q12010 RPT6YGL048C 1218 nt5.7□□□□□ -1.5
YPQ1Q12010 COS9YKL219W 1224 nt5.7□□□□□ -1.5
YPQ1Q12010 TFS1YLR178C 660 nt5.7□□□□□ -1.5
YPQ1Q12010 HCR1YLR192C 798 nt5.7□□□□□ -1.5
YPQ1Q12010 YBL070CYBL070C 321 nt5.7□□□□□ -1.5
YPQ1Q12010 XBP1YIL101C 1944 nt5.7□□□□□ -1.5
YPQ1Q12010 YJR015WYJR015W 1533 nt5.69□□□□□ -1.5
YPQ1Q12010 ERC1YHR032W 1746 nt5.69□□□□□ -1.5
YPQ1Q12010 PRO3YER023W 861 nt5.69□□□□□ -1.5
YPQ1Q12010 YER186CYER186C 921 nt5.69□□□□□ -1.5
YPQ1Q12010 KSS1YGR040W 1107 nt5.69□□□□□ -1.5
YPQ1Q12010 YOL097W-AYOL097W-A 186 nt5.69□□□□□ -1.5
YPQ1Q12010 YGL036WYGL036W 2730 nt5.69□□□□□ -1.5
YPQ1Q12010 YOL036WYOL036W 2286 nt5.69□□□□□ -1.5
YPQ1Q12010 ARA2YMR041C 1008 nt5.68□□□□□ -1.5
YPQ1Q12010 YPL062WYPL062W 405 nt5.68□□□□□ -1.5
YPQ1Q12010 YRF1-4YLR466W 4149 nt5.68□□□□□ -1.5
YPQ1Q12010 NOB1YOR056C 1380 nt5.67□□□□□ -1.5
YPQ1Q12010 PHO3YBR092C 1404 nt5.67□□□□□ -1.5
YPQ1Q12010 YER148W-AYER148W-A 579 nt5.67□□□□□ -1.5
YPQ1Q12010 SLO1YER180C-A 258 nt5.67□□□□□ -1.5
YPQ1Q12010 TPK1YJL164C 1194 nt5.67□□□□□ -1.5
YPQ1Q12010 CDC11YJR076C 1248 nt5.67□□□□□ -1.5
YPQ1Q12010 EFM3YJR129C 1020 nt5.67□□□□□ -1.5
YPQ1Q12010 YPR123CYPR123C 435 nt5.67□□□□□ -1.5
YPQ1Q12010 SOG2YOR353C 2376 nt5.67□□□□□ -1.5
YPQ1Q12010 PRP24YMR268C 1335 nt5.67□□□□□ -1.5
YPQ1Q12010 VNX1YNL321W 2727 nt5.66□□□□□ -1.5
YPQ1Q12010 YLL059CYLL059C 507 nt5.66□□□□□ -1.5
YPQ1Q12010 PUS5YLR165C 765 nt5.66□□□□□ -1.5
YPQ1Q12010 YOR318CYOR318C 306 nt5.66□□□□□ -1.5
YPQ1Q12010 MRS1YIR021W 1092 nt5.65□□□□□ -1.5
YPQ1Q12010 PGA3YML125C 939 nt5.65□□□□□ -1.5
YPQ1Q12010 SCO2YBR024W 906 nt5.65□□□□□ -1.5
YPQ1Q12010 MLC2YPR188C 492 nt5.65□□□□□ -1.5
YPQ1Q12010 GAT1YFL021W 1533 nt5.64□□□□□ -1.51
YPQ1Q12010 HSP78YDR258C 2436 nt5.64□□□□□ -1.51
YPQ1Q12010 RSP5YER125W 2430 nt5.64□□□□□ -1.51
YPQ1Q12010 BUL1YMR275C 2931 nt5.64□□□□□ -1.51
YPQ1Q12010 MHR1YDR296W 681 nt5.64□□□□□ -1.51
YPQ1Q12010 SFC1YJR095W 969 nt5.64□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.4 ms