Protein–RNA interactions for Protein: Q08923

CTI6, Histone deacetylase complex subunit CTI6, yeastyeast

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTI6Q08923 YBR226CYBR226C 411 nt6.95□□□□□ -1.3
CTI6Q08923 YHL017WYHL017W 1599 nt6.95□□□□□ -1.3
CTI6Q08923 AMD1YML035C 2433 nt6.95□□□□□ -1.3
CTI6Q08923 GFA1YKL104C 2154 nt6.94□□□□□ -1.3
CTI6Q08923 YFR034W-AYFR034W-A 288 nt6.94□□□□□ -1.3
CTI6Q08923 CDC16YKL022C 2523 nt6.94□□□□□ -1.3
CTI6Q08923 RTT106YNL206C 1368 nt6.94□□□□□ -1.3
CTI6Q08923 EHD3YDR036C 1503 nt6.93□□□□□ -1.3
CTI6Q08923 ICT1YLR099C 1185 nt6.93□□□□□ -1.3
CTI6Q08923 VRP1YLR337C 2454 nt6.92□□□□□ -1.3
CTI6Q08923 TOS2YGR221C 1869 nt6.92□□□□□ -1.3
CTI6Q08923 CYC8YBR112C 2901 nt6.92□□□□□ -1.3
CTI6Q08923 GIT1YCR098C 1557 nt6.92□□□□□ -1.3
CTI6Q08923 YCR075W-AYCR075W-A 228 nt6.92□□□□□ -1.3
CTI6Q08923 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt6.92□□□□□ -1.3
CTI6Q08923 YJR115WYJR115W 510 nt6.92□□□□□ -1.3
CTI6Q08923 YKL151CYKL151C 1014 nt6.92□□□□□ -1.3
CTI6Q08923 YCR061WYCR061W 1896 nt6.92□□□□□ -1.3
CTI6Q08923 FRS2YFL022C 1512 nt6.91□□□□□ -1.3
CTI6Q08923 YJR015WYJR015W 1533 nt6.91□□□□□ -1.3
CTI6Q08923 MCM3YEL032W 2916 nt6.9□□□□□ -1.3
CTI6Q08923 MRPL1YDR116C 858 nt6.9□□□□□ -1.3
CTI6Q08923 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt6.9□□□□□ -1.3
CTI6Q08923 RPT6YGL048C 1218 nt6.9□□□□□ -1.3
CTI6Q08923 PRP46YPL151C 1356 nt6.9□□□□□ -1.31
CTI6Q08923 MHR1YDR296W 681 nt6.89□□□□□ -1.31
CTI6Q08923 APS3YJL024C 585 nt6.89□□□□□ -1.31
CTI6Q08923 YDR514CYDR514C 1452 nt6.88□□□□□ -1.31
CTI6Q08923 TEP1YNL128W 1305 nt6.88□□□□□ -1.31
CTI6Q08923 RPT3YDR394W 1287 nt6.88□□□□□ -1.31
CTI6Q08923 PPM1YDR435C 987 nt6.88□□□□□ -1.31
CTI6Q08923 HSX1tR(CCU)J 72 nt6.88□□□□□ -1.31
CTI6Q08923 DJP1YIR004W 1299 nt6.88□□□□□ -1.31
CTI6Q08923 TFS1YLR178C 660 nt6.88□□□□□ -1.31
CTI6Q08923 REC114YMR133W 1287 nt6.88□□□□□ -1.31
CTI6Q08923 COS9YKL219W 1224 nt6.87□□□□□ -1.31
CTI6Q08923 YOR318CYOR318C 306 nt6.87□□□□□ -1.31
CTI6Q08923 HIR1YBL008W 2523 nt6.87□□□□□ -1.31
CTI6Q08923 NDC1YML031W 1968 nt6.86□□□□□ -1.31
CTI6Q08923 COX26YDR119W-A 201 nt6.86□□□□□ -1.31
CTI6Q08923 ATO3YDR384C 828 nt6.86□□□□□ -1.31
CTI6Q08923 ATG17YLR423C 1254 nt6.86□□□□□ -1.31
CTI6Q08923 ARA2YMR041C 1008 nt6.86□□□□□ -1.31
CTI6Q08923 HIS7YBR248C 1659 nt6.86□□□□□ -1.31
CTI6Q08923 EFT2YDR385W 2529 nt6.86□□□□□ -1.31
CTI6Q08923 EFT1YOR133W 2529 nt6.86□□□□□ -1.31
CTI6Q08923 SLO1YER180C-A 258 nt6.85□□□□□ -1.31
CTI6Q08923 RRP46YGR095C 672 nt6.85□□□□□ -1.31
CTI6Q08923 YOL097W-AYOL097W-A 186 nt6.85□□□□□ -1.31
CTI6Q08923 SAM4YPL273W 978 nt6.85□□□□□ -1.31
CTI6Q08923 BUD9YGR041W 1644 nt6.85□□□□□ -1.31
CTI6Q08923 PRO3YER023W 861 nt6.84□□□□□ -1.31
CTI6Q08923 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt6.84□□□□□ -1.31
CTI6Q08923 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt6.84□□□□□ -1.31
CTI6Q08923 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt6.84□□□□□ -1.31
CTI6Q08923 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt6.84□□□□□ -1.31
CTI6Q08923 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt6.84□□□□□ -1.31
CTI6Q08923 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt6.84□□□□□ -1.31
CTI6Q08923 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt6.84□□□□□ -1.31
CTI6Q08923 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt6.84□□□□□ -1.31
CTI6Q08923 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt6.84□□□□□ -1.31
CTI6Q08923 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt6.84□□□□□ -1.31
CTI6Q08923 HMS2YJR147W 1077 nt6.84□□□□□ -1.31
CTI6Q08923 MMP1YLL061W 1752 nt6.84□□□□□ -1.31
CTI6Q08923 YFL042CYFL042C 2025 nt6.83□□□□□ -1.32
CTI6Q08923 YML082WYML082W 1950 nt6.83□□□□□ -1.32
CTI6Q08923 YNL296WYNL296W 315 nt6.83□□□□□ -1.32
CTI6Q08923 SOG2YOR353C 2376 nt6.83□□□□□ -1.32
CTI6Q08923 YEN1YER041W 2280 nt6.83□□□□□ -1.32
CTI6Q08923 GDA1YEL042W 1557 nt6.82□□□□□ -1.32
CTI6Q08923 NUD1YOR373W 2556 nt6.82□□□□□ -1.32
CTI6Q08923 ESC8YOL017W 2145 nt6.82□□□□□ -1.32
CTI6Q08923 COX9YDL067C 180 nt6.82□□□□□ -1.32
CTI6Q08923 CAD1YDR423C 1230 nt6.82□□□□□ -1.32
CTI6Q08923 SEC20YDR498C 1152 nt6.82□□□□□ -1.32
CTI6Q08923 LCP5YER127W 1074 nt6.82□□□□□ -1.32
CTI6Q08923 LYS12YIL094C 1116 nt6.82□□□□□ -1.32
CTI6Q08923 PIN2YOR104W 849 nt6.82□□□□□ -1.32
CTI6Q08923 YBR124WYBR124W 360 nt6.82□□□□□ -1.32
CTI6Q08923 RMD9YGL107C 1941 nt6.82□□□□□ -1.32
CTI6Q08923 HXT2YMR011W 1626 nt6.81□□□□□ -1.32
CTI6Q08923 PET112YBL080C 1626 nt6.81□□□□□ -1.32
CTI6Q08923 YGR139WYGR139W 339 nt6.81□□□□□ -1.32
CTI6Q08923 CSG2YBR036C 1233 nt6.81□□□□□ -1.32
CTI6Q08923 BBP1YPL255W 1158 nt6.81□□□□□ -1.32
CTI6Q08923 VPS5YOR069W 2028 nt6.81□□□□□ -1.32
CTI6Q08923 PGK1YCR012W 1251 nt6.8□□□□□ -1.32
CTI6Q08923 GET3YDL100C 1065 nt6.8□□□□□ -1.32
CTI6Q08923 ATP14YLR295C 375 nt6.8□□□□□ -1.32
CTI6Q08923 ELP3YPL086C 1674 nt6.8□□□□□ -1.32
CTI6Q08923 ACS1YAL054C 2142 nt6.79□□□□□ -1.32
CTI6Q08923 LAG2YOL025W 1983 nt6.79□□□□□ -1.32
CTI6Q08923 YDL034WYDL034W 345 nt6.79□□□□□ -1.32
CTI6Q08923 YNR040WYNR040W 771 nt6.79□□□□□ -1.32
CTI6Q08923 NOG2YNR053C 1461 nt6.79□□□□□ -1.32
CTI6Q08923 PYC1YGL062W 3537 nt6.78□□□□□ -1.32
CTI6Q08923 BNS1YGR230W 414 nt6.78□□□□□ -1.32
CTI6Q08923 YGL036WYGL036W 2730 nt6.77□□□□□ -1.33
CTI6Q08923 OAC1YKL120W 975 nt6.77□□□□□ -1.33
CTI6Q08923 COT1YOR316C 1320 nt6.76□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 39 ms