Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IFITM3Q01628 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IFITM3Q01628 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IFITM3Q01628 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IFITM3Q01628 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IFITM3Q01628 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IFITM3Q01628 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IFITM3Q01628 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IFITM3Q01628 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IFITM3Q01628 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IFITM3Q01628 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IFITM3Q01628 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IFITM3Q01628 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IFITM3Q01628 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IFITM3Q01628 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IFITM3Q01628 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IFITM3Q01628 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IFITM3Q01628 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IFITM3Q01628 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IFITM3Q01628 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IFITM3Q01628 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
IFITM3Q01628 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IFITM3Q01628 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IFITM3Q01628 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
IFITM3Q01628 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
IFITM3Q01628 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
IFITM3Q01628 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IFITM3Q01628 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IFITM3Q01628 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IFITM3Q01628 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IFITM3Q01628 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IFITM3Q01628 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IFITM3Q01628 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IFITM3Q01628 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IFITM3Q01628 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IFITM3Q01628 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IFITM3Q01628 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IFITM3Q01628 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
IFITM3Q01628 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IFITM3Q01628 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IFITM3Q01628 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IFITM3Q01628 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IFITM3Q01628 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IFITM3Q01628 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IFITM3Q01628 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IFITM3Q01628 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
IFITM3Q01628 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IFITM3Q01628 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IFITM3Q01628 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IFITM3Q01628 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IFITM3Q01628 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IFITM3Q01628 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IFITM3Q01628 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
IFITM3Q01628 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IFITM3Q01628 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IFITM3Q01628 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IFITM3Q01628 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IFITM3Q01628 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IFITM3Q01628 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IFITM3Q01628 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IFITM3Q01628 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IFITM3Q01628 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IFITM3Q01628 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IFITM3Q01628 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IFITM3Q01628 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IFITM3Q01628 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IFITM3Q01628 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IFITM3Q01628 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IFITM3Q01628 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
IFITM3Q01628 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IFITM3Q01628 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IFITM3Q01628 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
IFITM3Q01628 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IFITM3Q01628 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
IFITM3Q01628 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IFITM3Q01628 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IFITM3Q01628 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
IFITM3Q01628 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IFITM3Q01628 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
IFITM3Q01628 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IFITM3Q01628 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
IFITM3Q01628 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IFITM3Q01628 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IFITM3Q01628 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IFITM3Q01628 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IFITM3Q01628 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IFITM3Q01628 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
IFITM3Q01628 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IFITM3Q01628 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IFITM3Q01628 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IFITM3Q01628 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
IFITM3Q01628 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
IFITM3Q01628 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IFITM3Q01628 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
IFITM3Q01628 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IFITM3Q01628 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
IFITM3Q01628 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IFITM3Q01628 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
IFITM3Q01628 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IFITM3Q01628 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 372.5 ms