Protein–RNA interactions for Protein: P62079

TSPAN5, Tetraspanin-5, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN5P62079 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TSPAN5P62079 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSPAN5P62079 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSPAN5P62079 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSPAN5P62079 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSPAN5P62079 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSPAN5P62079 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSPAN5P62079 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSPAN5P62079 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TSPAN5P62079 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSPAN5P62079 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSPAN5P62079 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSPAN5P62079 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSPAN5P62079 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSPAN5P62079 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSPAN5P62079 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSPAN5P62079 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSPAN5P62079 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSPAN5P62079 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSPAN5P62079 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSPAN5P62079 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSPAN5P62079 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSPAN5P62079 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSPAN5P62079 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSPAN5P62079 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSPAN5P62079 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TSPAN5P62079 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSPAN5P62079 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSPAN5P62079 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSPAN5P62079 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSPAN5P62079 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSPAN5P62079 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSPAN5P62079 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSPAN5P62079 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSPAN5P62079 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSPAN5P62079 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSPAN5P62079 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSPAN5P62079 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSPAN5P62079 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TSPAN5P62079 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSPAN5P62079 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSPAN5P62079 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSPAN5P62079 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPAN5P62079 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPAN5P62079 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPAN5P62079 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPAN5P62079 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPAN5P62079 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPAN5P62079 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPAN5P62079 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPAN5P62079 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPAN5P62079 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPAN5P62079 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSPAN5P62079 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSPAN5P62079 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSPAN5P62079 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSPAN5P62079 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSPAN5P62079 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSPAN5P62079 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSPAN5P62079 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSPAN5P62079 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSPAN5P62079 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSPAN5P62079 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSPAN5P62079 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSPAN5P62079 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSPAN5P62079 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TSPAN5P62079 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSPAN5P62079 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSPAN5P62079 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSPAN5P62079 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSPAN5P62079 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSPAN5P62079 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSPAN5P62079 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSPAN5P62079 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSPAN5P62079 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSPAN5P62079 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSPAN5P62079 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TSPAN5P62079 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSPAN5P62079 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSPAN5P62079 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TSPAN5P62079 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN5P62079 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN5P62079 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN5P62079 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN5P62079 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN5P62079 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN5P62079 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN5P62079 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN5P62079 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN5P62079 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN5P62079 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSPAN5P62079 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSPAN5P62079 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSPAN5P62079 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSPAN5P62079 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSPAN5P62079 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSPAN5P62079 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSPAN5P62079 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSPAN5P62079 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSPAN5P62079 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 194 ms