Protein–RNA interactions for Protein: P60891

PRPS1, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPS1P60891 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPS1P60891 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPS1P60891 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPS1P60891 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPS1P60891 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPS1P60891 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPS1P60891 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPS1P60891 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPS1P60891 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPS1P60891 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPS1P60891 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPS1P60891 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPS1P60891 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPS1P60891 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPS1P60891 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPS1P60891 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPS1P60891 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPS1P60891 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPS1P60891 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPS1P60891 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPS1P60891 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPS1P60891 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPS1P60891 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPS1P60891 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPS1P60891 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPS1P60891 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPS1P60891 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPS1P60891 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPS1P60891 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPS1P60891 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPS1P60891 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPS1P60891 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPS1P60891 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPS1P60891 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPS1P60891 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPS1P60891 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPS1P60891 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPS1P60891 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPS1P60891 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPS1P60891 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRPS1P60891 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPS1P60891 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPS1P60891 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPS1P60891 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPS1P60891 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPS1P60891 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPS1P60891 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPS1P60891 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPS1P60891 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPS1P60891 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPS1P60891 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPS1P60891 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPS1P60891 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPS1P60891 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPS1P60891 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPS1P60891 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPS1P60891 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPS1P60891 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPS1P60891 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPS1P60891 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPS1P60891 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPS1P60891 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPS1P60891 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPS1P60891 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPS1P60891 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPS1P60891 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPS1P60891 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPS1P60891 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPS1P60891 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPS1P60891 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPS1P60891 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPS1P60891 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPS1P60891 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPS1P60891 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPS1P60891 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPS1P60891 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPS1P60891 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPS1P60891 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPS1P60891 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPS1P60891 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPS1P60891 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPS1P60891 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPS1P60891 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPS1P60891 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPS1P60891 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPS1P60891 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPS1P60891 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPS1P60891 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPS1P60891 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPS1P60891 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPS1P60891 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPS1P60891 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPS1P60891 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPS1P60891 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPS1P60891 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPS1P60891 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPS1P60891 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPS1P60891 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPS1P60891 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPS1P60891 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms