Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TGM4P49221 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TGM4P49221 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TGM4P49221 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TGM4P49221 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TGM4P49221 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TGM4P49221 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TGM4P49221 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TGM4P49221 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TGM4P49221 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TGM4P49221 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TGM4P49221 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TGM4P49221 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TGM4P49221 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TGM4P49221 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TGM4P49221 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TGM4P49221 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TGM4P49221 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TGM4P49221 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TGM4P49221 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TGM4P49221 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TGM4P49221 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TGM4P49221 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TGM4P49221 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TGM4P49221 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TGM4P49221 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TGM4P49221 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TGM4P49221 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TGM4P49221 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TGM4P49221 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TGM4P49221 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TGM4P49221 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TGM4P49221 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TGM4P49221 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TGM4P49221 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TGM4P49221 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TGM4P49221 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TGM4P49221 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TGM4P49221 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TGM4P49221 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TGM4P49221 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TGM4P49221 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TGM4P49221 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TGM4P49221 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TGM4P49221 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TGM4P49221 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TGM4P49221 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TGM4P49221 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TGM4P49221 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TGM4P49221 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TGM4P49221 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TGM4P49221 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TGM4P49221 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TGM4P49221 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TGM4P49221 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TGM4P49221 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TGM4P49221 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TGM4P49221 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TGM4P49221 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TGM4P49221 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TGM4P49221 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TGM4P49221 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TGM4P49221 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TGM4P49221 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TGM4P49221 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TGM4P49221 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TGM4P49221 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TGM4P49221 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TGM4P49221 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TGM4P49221 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TGM4P49221 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TGM4P49221 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TGM4P49221 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TGM4P49221 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TGM4P49221 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TGM4P49221 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TGM4P49221 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TGM4P49221 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TGM4P49221 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TGM4P49221 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TGM4P49221 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TGM4P49221 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TGM4P49221 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TGM4P49221 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TGM4P49221 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TGM4P49221 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TGM4P49221 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TGM4P49221 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TGM4P49221 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TGM4P49221 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TGM4P49221 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TGM4P49221 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TGM4P49221 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TGM4P49221 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TGM4P49221 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TGM4P49221 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TGM4P49221 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TGM4P49221 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TGM4P49221 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TGM4P49221 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.2 ms