Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATRXP46100 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATRXP46100 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATRXP46100 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATRXP46100 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATRXP46100 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATRXP46100 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATRXP46100 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATRXP46100 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATRXP46100 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATRXP46100 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATRXP46100 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATRXP46100 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATRXP46100 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATRXP46100 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATRXP46100 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATRXP46100 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATRXP46100 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATRXP46100 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATRXP46100 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATRXP46100 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATRXP46100 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATRXP46100 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATRXP46100 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATRXP46100 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATRXP46100 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATRXP46100 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATRXP46100 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATRXP46100 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ATRXP46100 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATRXP46100 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ATRXP46100 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATRXP46100 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATRXP46100 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATRXP46100 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATRXP46100 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATRXP46100 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATRXP46100 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATRXP46100 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATRXP46100 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATRXP46100 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATRXP46100 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATRXP46100 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATRXP46100 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATRXP46100 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATRXP46100 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATRXP46100 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATRXP46100 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATRXP46100 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATRXP46100 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATRXP46100 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATRXP46100 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATRXP46100 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ATRXP46100 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATRXP46100 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATRXP46100 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATRXP46100 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATRXP46100 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATRXP46100 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATRXP46100 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATRXP46100 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATRXP46100 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATRXP46100 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATRXP46100 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATRXP46100 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATRXP46100 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATRXP46100 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATRXP46100 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATRXP46100 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATRXP46100 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATRXP46100 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATRXP46100 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ATRXP46100 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ATRXP46100 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATRXP46100 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATRXP46100 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATRXP46100 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATRXP46100 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATRXP46100 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATRXP46100 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATRXP46100 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATRXP46100 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATRXP46100 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ATRXP46100 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ATRXP46100 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATRXP46100 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ATRXP46100 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATRXP46100 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATRXP46100 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATRXP46100 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATRXP46100 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATRXP46100 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATRXP46100 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ATRXP46100 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATRXP46100 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATRXP46100 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATRXP46100 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATRXP46100 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATRXP46100 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATRXP46100 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms