Protein–RNA interactions for Protein: P38202

YBL028C, UPF0642 protein YBL028C, yeastyeast

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YBL028CP38202 POP1YNL221C 2628 nt6.49□□□□□ -1.37
YBL028CP38202 PGU1YJR153W 1086 nt6.49□□□□□ -1.37
YBL028CP38202 RRP46YGR095C 672 nt6.48□□□□□ -1.37
YBL028CP38202 CDC11YJR076C 1248 nt6.48□□□□□ -1.37
YBL028CP38202 SSO1YPL232W 873 nt6.48□□□□□ -1.37
YBL028CP38202 YBR124WYBR124W 360 nt6.48□□□□□ -1.37
YBL028CP38202 RSC2YLR357W 2670 nt6.47□□□□□ -1.37
YBL028CP38202 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt6.47□□□□□ -1.37
YBL028CP38202 ATO3YDR384C 828 nt6.47□□□□□ -1.37
YBL028CP38202 YGR127WYGR127W 939 nt6.47□□□□□ -1.37
YBL028CP38202 THI4YGR144W 981 nt6.47□□□□□ -1.37
YBL028CP38202 TIM54YJL054W 1437 nt6.47□□□□□ -1.37
YBL028CP38202 CDC16YKL022C 2523 nt6.47□□□□□ -1.37
YBL028CP38202 MSN2YMR037C 2115 nt6.47□□□□□ -1.37
YBL028CP38202 CLN1YMR199W 1641 nt6.47□□□□□ -1.37
YBL028CP38202 YFL052WYFL052W 1398 nt6.46□□□□□ -1.37
YBL028CP38202 YGL194C-AYGL194C-A 243 nt6.46□□□□□ -1.38
YBL028CP38202 HAP2YGL237C 798 nt6.46□□□□□ -1.38
YBL028CP38202 HSX1tR(CCU)J 72 nt6.46□□□□□ -1.38
YBL028CP38202 SUP2tY(GUA)D 75 nt6.46□□□□□ -1.38
YBL028CP38202 SUP11tY(GUA)F1 75 nt6.46□□□□□ -1.38
YBL028CP38202 SUP6tY(GUA)F2 75 nt6.46□□□□□ -1.38
YBL028CP38202 SUP7tY(GUA)J1 75 nt6.46□□□□□ -1.38
YBL028CP38202 SUP4tY(GUA)J2 75 nt6.46□□□□□ -1.38
YBL028CP38202 SUP5tY(GUA)M1 75 nt6.46□□□□□ -1.38
YBL028CP38202 SUP8tY(GUA)M2 75 nt6.46□□□□□ -1.38
YBL028CP38202 SUP3tY(GUA)O 75 nt6.46□□□□□ -1.38
YBL028CP38202 RRN10YBL025W 438 nt6.46□□□□□ -1.38
YBL028CP38202 IFA38YBR159W 1044 nt6.46□□□□□ -1.38
YBL028CP38202 IMA2YOL157C 1770 nt6.46□□□□□ -1.38
YBL028CP38202 YML082WYML082W 1950 nt6.46□□□□□ -1.38
YBL028CP38202 RAD3YER171W 2337 nt6.45□□□□□ -1.38
YBL028CP38202 RTT106YNL206C 1368 nt6.45□□□□□ -1.38
YBL028CP38202 SEC20YDR498C 1152 nt6.45□□□□□ -1.38
YBL028CP38202 YGR182CYGR182C 354 nt6.45□□□□□ -1.38
YBL028CP38202 NPA3YJR072C 1158 nt6.45□□□□□ -1.38
YBL028CP38202 SFC1YJR095W 969 nt6.45□□□□□ -1.38
YBL028CP38202 YJR115WYJR115W 510 nt6.45□□□□□ -1.38
YBL028CP38202 CSG2YBR036C 1233 nt6.45□□□□□ -1.38
YBL028CP38202 YPL062WYPL062W 405 nt6.45□□□□□ -1.38
YBL028CP38202 PCS60YBR222C 1632 nt6.45□□□□□ -1.38
YBL028CP38202 CHS5YLR330W 2016 nt6.44□□□□□ -1.38
YBL028CP38202 PGK1YCR012W 1251 nt6.44□□□□□ -1.38
YBL028CP38202 CTF8YHR191C 402 nt6.44□□□□□ -1.38
YBL028CP38202 YJU3YKL094W 942 nt6.44□□□□□ -1.38
YBL028CP38202 ASN1YPR145W 1719 nt6.44□□□□□ -1.38
YBL028CP38202 NUD1YOR373W 2556 nt6.44□□□□□ -1.38
YBL028CP38202 YRF1-4YLR466W 4149 nt6.43□□□□□ -1.38
YBL028CP38202 COX26YDR119W-A 201 nt6.43□□□□□ -1.38
YBL028CP38202 YKL151CYKL151C 1014 nt6.43□□□□□ -1.38
YBL028CP38202 TFS1YLR178C 660 nt6.43□□□□□ -1.38
YBL028CP38202 CMR1YDL156W 1569 nt6.43□□□□□ -1.38
YBL028CP38202 SPS22YCL048W 1392 nt6.43□□□□□ -1.38
YBL028CP38202 RSP5YER125W 2430 nt6.42□□□□□ -1.38
YBL028CP38202 YER010CYER010C 705 nt6.42□□□□□ -1.38
YBL028CP38202 RME1YGR044C 903 nt6.42□□□□□ -1.38
YBL028CP38202 PIN2YOR104W 849 nt6.42□□□□□ -1.38
YBL028CP38202 RPN7YPR108W 1290 nt6.42□□□□□ -1.38
YBL028CP38202 KNS1YLL019C 2214 nt6.42□□□□□ -1.38
YBL028CP38202 NOB1YOR056C 1380 nt6.42□□□□□ -1.38
YBL028CP38202 YGL036WYGL036W 2730 nt6.41□□□□□ -1.38
YBL028CP38202 MAK32YCR019W 1092 nt6.41□□□□□ -1.38
YBL028CP38202 tX(XXX)DtX(XXX)D 100 nt6.41□□□□□ -1.38
YBL028CP38202 YOL163WYOL163W 510 nt6.41□□□□□ -1.38
YBL028CP38202 YEL020CYEL020C 1683 nt6.41□□□□□ -1.38
YBL028CP38202 KDX1YKL161C 1302 nt6.41□□□□□ -1.38
YBL028CP38202 YPK2YMR104C 2034 nt6.4□□□□□ -1.38
YBL028CP38202 YME1YPR024W 2244 nt6.4□□□□□ -1.38
YBL028CP38202 MNN5YJL186W 1761 nt6.4□□□□□ -1.38
YBL028CP38202 YUR1YJL139C 1287 nt6.4□□□□□ -1.38
YBL028CP38202 COS9YKL219W 1224 nt6.4□□□□□ -1.38
YBL028CP38202 YLR283WYLR283W 945 nt6.4□□□□□ -1.38
YBL028CP38202 YML083CYML083C 1257 nt6.4□□□□□ -1.38
YBL028CP38202 YOL097W-AYOL097W-A 186 nt6.4□□□□□ -1.38
YBL028CP38202 YPL277CYPL277C 1464 nt6.4□□□□□ -1.39
YBL028CP38202 YJR015WYJR015W 1533 nt6.4□□□□□ -1.39
YBL028CP38202 SOG2YOR353C 2376 nt6.39□□□□□ -1.39
YBL028CP38202 CAD1YDR423C 1230 nt6.39□□□□□ -1.39
YBL028CP38202 RPT6YGL048C 1218 nt6.39□□□□□ -1.39
YBL028CP38202 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt6.39□□□□□ -1.39
YBL028CP38202 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt6.39□□□□□ -1.39
YBL028CP38202 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt6.39□□□□□ -1.39
YBL028CP38202 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt6.39□□□□□ -1.39
YBL028CP38202 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt6.39□□□□□ -1.39
YBL028CP38202 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt6.39□□□□□ -1.39
YBL028CP38202 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt6.39□□□□□ -1.39
YBL028CP38202 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt6.39□□□□□ -1.39
YBL028CP38202 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt6.39□□□□□ -1.39
YBL028CP38202 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt6.39□□□□□ -1.39
YBL028CP38202 FAF1YIL019W 1041 nt6.39□□□□□ -1.39
YBL028CP38202 STM1YLR150W 822 nt6.39□□□□□ -1.39
YBL028CP38202 DIA3YDL024C 1407 nt6.39□□□□□ -1.39
YBL028CP38202 DUG1YFR044C 1446 nt6.39□□□□□ -1.39
YBL028CP38202 GDA1YEL042W 1557 nt6.39□□□□□ -1.39
YBL028CP38202 MHR1YDR296W 681 nt6.38□□□□□ -1.39
YBL028CP38202 SLO1YER180C-A 258 nt6.38□□□□□ -1.39
YBL028CP38202 EFT2YDR385W 2529 nt6.37□□□□□ -1.39
YBL028CP38202 EFT1YOR133W 2529 nt6.37□□□□□ -1.39
YBL028CP38202 YHL017WYHL017W 1599 nt6.37□□□□□ -1.39
YBL028CP38202 SUB2YDL084W 1341 nt6.37□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 21.3 ms