Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXD13P35453 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXD13P35453 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXD13P35453 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXD13P35453 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXD13P35453 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXD13P35453 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXD13P35453 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXD13P35453 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXD13P35453 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXD13P35453 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXD13P35453 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXD13P35453 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXD13P35453 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXD13P35453 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXD13P35453 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXD13P35453 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXD13P35453 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXD13P35453 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXD13P35453 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXD13P35453 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXD13P35453 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXD13P35453 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXD13P35453 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXD13P35453 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXD13P35453 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXD13P35453 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXD13P35453 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXD13P35453 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXD13P35453 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXD13P35453 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
HOXD13P35453 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
HOXD13P35453 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXD13P35453 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXD13P35453 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXD13P35453 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXD13P35453 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXD13P35453 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXD13P35453 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXD13P35453 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXD13P35453 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXD13P35453 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXD13P35453 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXD13P35453 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXD13P35453 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXD13P35453 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXD13P35453 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXD13P35453 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXD13P35453 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXD13P35453 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXD13P35453 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXD13P35453 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXD13P35453 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXD13P35453 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXD13P35453 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXD13P35453 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXD13P35453 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXD13P35453 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXD13P35453 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXD13P35453 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXD13P35453 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXD13P35453 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXD13P35453 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXD13P35453 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXD13P35453 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXD13P35453 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXD13P35453 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXD13P35453 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXD13P35453 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXD13P35453 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXD13P35453 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXD13P35453 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXD13P35453 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXD13P35453 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXD13P35453 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXD13P35453 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXD13P35453 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXD13P35453 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXD13P35453 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXD13P35453 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXD13P35453 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXD13P35453 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HOXD13P35453 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HOXD13P35453 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HOXD13P35453 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HOXD13P35453 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HOXD13P35453 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HOXD13P35453 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HOXD13P35453 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HOXD13P35453 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXD13P35453 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXD13P35453 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXD13P35453 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXD13P35453 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXD13P35453 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXD13P35453 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXD13P35453 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXD13P35453 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXD13P35453 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXD13P35453 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms