Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFTPDP35247 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFTPDP35247 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFTPDP35247 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFTPDP35247 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFTPDP35247 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFTPDP35247 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFTPDP35247 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFTPDP35247 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFTPDP35247 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFTPDP35247 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFTPDP35247 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFTPDP35247 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFTPDP35247 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFTPDP35247 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFTPDP35247 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SFTPDP35247 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFTPDP35247 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFTPDP35247 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFTPDP35247 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFTPDP35247 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFTPDP35247 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFTPDP35247 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFTPDP35247 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFTPDP35247 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFTPDP35247 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFTPDP35247 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFTPDP35247 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFTPDP35247 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFTPDP35247 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFTPDP35247 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFTPDP35247 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFTPDP35247 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFTPDP35247 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFTPDP35247 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFTPDP35247 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFTPDP35247 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFTPDP35247 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFTPDP35247 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFTPDP35247 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFTPDP35247 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFTPDP35247 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFTPDP35247 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFTPDP35247 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFTPDP35247 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFTPDP35247 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFTPDP35247 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFTPDP35247 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFTPDP35247 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SFTPDP35247 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFTPDP35247 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFTPDP35247 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFTPDP35247 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFTPDP35247 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFTPDP35247 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFTPDP35247 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFTPDP35247 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFTPDP35247 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SFTPDP35247 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SFTPDP35247 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SFTPDP35247 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFTPDP35247 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFTPDP35247 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFTPDP35247 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFTPDP35247 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFTPDP35247 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFTPDP35247 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFTPDP35247 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFTPDP35247 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFTPDP35247 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SFTPDP35247 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFTPDP35247 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFTPDP35247 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFTPDP35247 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFTPDP35247 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFTPDP35247 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFTPDP35247 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFTPDP35247 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFTPDP35247 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFTPDP35247 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SFTPDP35247 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFTPDP35247 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFTPDP35247 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFTPDP35247 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFTPDP35247 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFTPDP35247 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFTPDP35247 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFTPDP35247 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFTPDP35247 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFTPDP35247 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SFTPDP35247 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFTPDP35247 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFTPDP35247 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFTPDP35247 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFTPDP35247 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFTPDP35247 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFTPDP35247 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFTPDP35247 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SFTPDP35247 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFTPDP35247 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms