Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RLBP1P12271 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RLBP1P12271 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RLBP1P12271 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RLBP1P12271 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RLBP1P12271 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RLBP1P12271 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RLBP1P12271 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RLBP1P12271 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RLBP1P12271 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RLBP1P12271 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RLBP1P12271 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RLBP1P12271 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RLBP1P12271 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RLBP1P12271 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RLBP1P12271 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RLBP1P12271 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RLBP1P12271 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RLBP1P12271 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RLBP1P12271 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RLBP1P12271 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RLBP1P12271 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RLBP1P12271 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RLBP1P12271 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RLBP1P12271 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RLBP1P12271 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
RLBP1P12271 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
RLBP1P12271 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
RLBP1P12271 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
RLBP1P12271 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
RLBP1P12271 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RLBP1P12271 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RLBP1P12271 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RLBP1P12271 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RLBP1P12271 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RLBP1P12271 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RLBP1P12271 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RLBP1P12271 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RLBP1P12271 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RLBP1P12271 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RLBP1P12271 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RLBP1P12271 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RLBP1P12271 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RLBP1P12271 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RLBP1P12271 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RLBP1P12271 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RLBP1P12271 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RLBP1P12271 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RLBP1P12271 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
RLBP1P12271 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RLBP1P12271 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RLBP1P12271 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
RLBP1P12271 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
RLBP1P12271 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RLBP1P12271 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
RLBP1P12271 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
RLBP1P12271 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RLBP1P12271 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RLBP1P12271 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RLBP1P12271 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
RLBP1P12271 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
RLBP1P12271 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RLBP1P12271 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RLBP1P12271 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RLBP1P12271 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RLBP1P12271 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RLBP1P12271 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
RLBP1P12271 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RLBP1P12271 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
RLBP1P12271 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
RLBP1P12271 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
RLBP1P12271 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
RLBP1P12271 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RLBP1P12271 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
RLBP1P12271 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
RLBP1P12271 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RLBP1P12271 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RLBP1P12271 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RLBP1P12271 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
RLBP1P12271 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RLBP1P12271 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RLBP1P12271 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RLBP1P12271 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RLBP1P12271 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RLBP1P12271 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
RLBP1P12271 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RLBP1P12271 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RLBP1P12271 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RLBP1P12271 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RLBP1P12271 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RLBP1P12271 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RLBP1P12271 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RLBP1P12271 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RLBP1P12271 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RLBP1P12271 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
RLBP1P12271 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RLBP1P12271 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RLBP1P12271 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RLBP1P12271 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RLBP1P12271 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms