Protein–RNA interactions for Protein: P04000

OPN1LW, Long-wave-sensitive opsin 1, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN1LWP04000 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
OPN1LWP04000 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OPN1LWP04000 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OPN1LWP04000 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
OPN1LWP04000 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
OPN1LWP04000 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OPN1LWP04000 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
OPN1LWP04000 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OPN1LWP04000 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OPN1LWP04000 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
OPN1LWP04000 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OPN1LWP04000 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OPN1LWP04000 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
OPN1LWP04000 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OPN1LWP04000 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OPN1LWP04000 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OPN1LWP04000 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OPN1LWP04000 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
OPN1LWP04000 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OPN1LWP04000 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
OPN1LWP04000 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OPN1LWP04000 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OPN1LWP04000 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OPN1LWP04000 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OPN1LWP04000 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OPN1LWP04000 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OPN1LWP04000 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
OPN1LWP04000 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OPN1LWP04000 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OPN1LWP04000 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OPN1LWP04000 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
OPN1LWP04000 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OPN1LWP04000 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OPN1LWP04000 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OPN1LWP04000 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OPN1LWP04000 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OPN1LWP04000 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OPN1LWP04000 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OPN1LWP04000 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
OPN1LWP04000 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
OPN1LWP04000 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OPN1LWP04000 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
OPN1LWP04000 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OPN1LWP04000 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
OPN1LWP04000 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OPN1LWP04000 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
OPN1LWP04000 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OPN1LWP04000 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OPN1LWP04000 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OPN1LWP04000 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OPN1LWP04000 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OPN1LWP04000 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
OPN1LWP04000 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OPN1LWP04000 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OPN1LWP04000 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OPN1LWP04000 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OPN1LWP04000 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OPN1LWP04000 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
OPN1LWP04000 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
OPN1LWP04000 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
OPN1LWP04000 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OPN1LWP04000 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OPN1LWP04000 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OPN1LWP04000 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OPN1LWP04000 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
OPN1LWP04000 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OPN1LWP04000 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
OPN1LWP04000 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OPN1LWP04000 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OPN1LWP04000 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OPN1LWP04000 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OPN1LWP04000 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OPN1LWP04000 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OPN1LWP04000 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OPN1LWP04000 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OPN1LWP04000 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OPN1LWP04000 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OPN1LWP04000 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OPN1LWP04000 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OPN1LWP04000 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
OPN1LWP04000 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OPN1LWP04000 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OPN1LWP04000 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OPN1LWP04000 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OPN1LWP04000 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OPN1LWP04000 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
OPN1LWP04000 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
OPN1LWP04000 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
OPN1LWP04000 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
OPN1LWP04000 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OPN1LWP04000 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OPN1LWP04000 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OPN1LWP04000 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OPN1LWP04000 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OPN1LWP04000 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OPN1LWP04000 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OPN1LWP04000 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OPN1LWP04000 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OPN1LWP04000 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OPN1LWP04000 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms