Protein–RNA interactions for Protein: O76039

CDKL5, Cyclin-dependent kinase-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL5O76039 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDKL5O76039 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDKL5O76039 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CDKL5O76039 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDKL5O76039 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDKL5O76039 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDKL5O76039 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDKL5O76039 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDKL5O76039 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDKL5O76039 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDKL5O76039 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDKL5O76039 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDKL5O76039 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDKL5O76039 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDKL5O76039 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDKL5O76039 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDKL5O76039 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDKL5O76039 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDKL5O76039 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDKL5O76039 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDKL5O76039 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDKL5O76039 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDKL5O76039 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDKL5O76039 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDKL5O76039 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDKL5O76039 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDKL5O76039 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDKL5O76039 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDKL5O76039 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDKL5O76039 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CDKL5O76039 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDKL5O76039 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDKL5O76039 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDKL5O76039 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CDKL5O76039 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDKL5O76039 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDKL5O76039 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDKL5O76039 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CDKL5O76039 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDKL5O76039 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDKL5O76039 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CDKL5O76039 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDKL5O76039 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CDKL5O76039 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CDKL5O76039 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CDKL5O76039 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CDKL5O76039 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDKL5O76039 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDKL5O76039 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDKL5O76039 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CDKL5O76039 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CDKL5O76039 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDKL5O76039 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CDKL5O76039 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDKL5O76039 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDKL5O76039 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDKL5O76039 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDKL5O76039 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CDKL5O76039 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDKL5O76039 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDKL5O76039 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CDKL5O76039 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDKL5O76039 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CDKL5O76039 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CDKL5O76039 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDKL5O76039 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CDKL5O76039 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDKL5O76039 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDKL5O76039 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CDKL5O76039 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDKL5O76039 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CDKL5O76039 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CDKL5O76039 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CDKL5O76039 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CDKL5O76039 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
CDKL5O76039 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
CDKL5O76039 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CDKL5O76039 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDKL5O76039 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CDKL5O76039 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDKL5O76039 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDKL5O76039 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDKL5O76039 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDKL5O76039 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDKL5O76039 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDKL5O76039 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDKL5O76039 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CDKL5O76039 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDKL5O76039 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDKL5O76039 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDKL5O76039 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDKL5O76039 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDKL5O76039 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDKL5O76039 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CDKL5O76039 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CDKL5O76039 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDKL5O76039 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDKL5O76039 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CDKL5O76039 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CDKL5O76039 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms