Protein–RNA interactions for Protein: O15554

KCNN4, Intermediate conductance calcium-activated potassium channel protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNN4O15554 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNN4O15554 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNN4O15554 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNN4O15554 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNN4O15554 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNN4O15554 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNN4O15554 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNN4O15554 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNN4O15554 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNN4O15554 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNN4O15554 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNN4O15554 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNN4O15554 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNN4O15554 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNN4O15554 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNN4O15554 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNN4O15554 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNN4O15554 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNN4O15554 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNN4O15554 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNN4O15554 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNN4O15554 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNN4O15554 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNN4O15554 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNN4O15554 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNN4O15554 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNN4O15554 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNN4O15554 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNN4O15554 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNN4O15554 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNN4O15554 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNN4O15554 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNN4O15554 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNN4O15554 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNN4O15554 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNN4O15554 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNN4O15554 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNN4O15554 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNN4O15554 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KCNN4O15554 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNN4O15554 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNN4O15554 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNN4O15554 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNN4O15554 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNN4O15554 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNN4O15554 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNN4O15554 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNN4O15554 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNN4O15554 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNN4O15554 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNN4O15554 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNN4O15554 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNN4O15554 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNN4O15554 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNN4O15554 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNN4O15554 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNN4O15554 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNN4O15554 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNN4O15554 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNN4O15554 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNN4O15554 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNN4O15554 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNN4O15554 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNN4O15554 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNN4O15554 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNN4O15554 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNN4O15554 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNN4O15554 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNN4O15554 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNN4O15554 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNN4O15554 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNN4O15554 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNN4O15554 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNN4O15554 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNN4O15554 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNN4O15554 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNN4O15554 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNN4O15554 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNN4O15554 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNN4O15554 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNN4O15554 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNN4O15554 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNN4O15554 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNN4O15554 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNN4O15554 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNN4O15554 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNN4O15554 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNN4O15554 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNN4O15554 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNN4O15554 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNN4O15554 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNN4O15554 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNN4O15554 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNN4O15554 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNN4O15554 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNN4O15554 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNN4O15554 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNN4O15554 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNN4O15554 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNN4O15554 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms