Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC169A6NNP5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC169A6NNP5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC169A6NNP5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC169A6NNP5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC169A6NNP5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC169A6NNP5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC169A6NNP5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC169A6NNP5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC169A6NNP5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC169A6NNP5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC169A6NNP5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC169A6NNP5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC169A6NNP5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC169A6NNP5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC169A6NNP5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC169A6NNP5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC169A6NNP5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC169A6NNP5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC169A6NNP5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC169A6NNP5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC169A6NNP5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC169A6NNP5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC169A6NNP5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC169A6NNP5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC169A6NNP5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC169A6NNP5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC169A6NNP5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC169A6NNP5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC169A6NNP5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC169A6NNP5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC169A6NNP5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC169A6NNP5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC169A6NNP5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC169A6NNP5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC169A6NNP5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC169A6NNP5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC169A6NNP5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC169A6NNP5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC169A6NNP5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC169A6NNP5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC169A6NNP5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC169A6NNP5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC169A6NNP5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC169A6NNP5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC169A6NNP5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC169A6NNP5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC169A6NNP5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC169A6NNP5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC169A6NNP5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC169A6NNP5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC169A6NNP5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC169A6NNP5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC169A6NNP5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC169A6NNP5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC169A6NNP5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC169A6NNP5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC169A6NNP5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC169A6NNP5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC169A6NNP5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC169A6NNP5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC169A6NNP5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC169A6NNP5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC169A6NNP5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC169A6NNP5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC169A6NNP5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC169A6NNP5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC169A6NNP5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC169A6NNP5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC169A6NNP5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC169A6NNP5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC169A6NNP5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC169A6NNP5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC169A6NNP5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC169A6NNP5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC169A6NNP5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC169A6NNP5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC169A6NNP5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC169A6NNP5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC169A6NNP5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC169A6NNP5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC169A6NNP5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC169A6NNP5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC169A6NNP5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC169A6NNP5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC169A6NNP5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC169A6NNP5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC169A6NNP5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC169A6NNP5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC169A6NNP5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC169A6NNP5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC169A6NNP5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC169A6NNP5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC169A6NNP5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC169A6NNP5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC169A6NNP5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC169A6NNP5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC169A6NNP5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC169A6NNP5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC169A6NNP5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms