Protein–RNA interactions for Protein: A6NIR3

AGAP5, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP5A6NIR3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGAP5A6NIR3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGAP5A6NIR3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGAP5A6NIR3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
AGAP5A6NIR3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
AGAP5A6NIR3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGAP5A6NIR3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
AGAP5A6NIR3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGAP5A6NIR3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGAP5A6NIR3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGAP5A6NIR3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGAP5A6NIR3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGAP5A6NIR3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGAP5A6NIR3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
AGAP5A6NIR3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
AGAP5A6NIR3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGAP5A6NIR3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGAP5A6NIR3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGAP5A6NIR3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGAP5A6NIR3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGAP5A6NIR3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGAP5A6NIR3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGAP5A6NIR3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGAP5A6NIR3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGAP5A6NIR3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGAP5A6NIR3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGAP5A6NIR3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGAP5A6NIR3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGAP5A6NIR3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGAP5A6NIR3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGAP5A6NIR3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGAP5A6NIR3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGAP5A6NIR3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGAP5A6NIR3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGAP5A6NIR3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGAP5A6NIR3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGAP5A6NIR3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGAP5A6NIR3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGAP5A6NIR3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGAP5A6NIR3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGAP5A6NIR3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGAP5A6NIR3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGAP5A6NIR3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGAP5A6NIR3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGAP5A6NIR3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGAP5A6NIR3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGAP5A6NIR3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGAP5A6NIR3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGAP5A6NIR3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGAP5A6NIR3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGAP5A6NIR3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGAP5A6NIR3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGAP5A6NIR3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGAP5A6NIR3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGAP5A6NIR3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGAP5A6NIR3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
AGAP5A6NIR3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGAP5A6NIR3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGAP5A6NIR3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGAP5A6NIR3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGAP5A6NIR3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGAP5A6NIR3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AGAP5A6NIR3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AGAP5A6NIR3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AGAP5A6NIR3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22■■□□□ 1.11
AGAP5A6NIR3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AGAP5A6NIR3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AGAP5A6NIR3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AGAP5A6NIR3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
AGAP5A6NIR3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGAP5A6NIR3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGAP5A6NIR3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGAP5A6NIR3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGAP5A6NIR3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGAP5A6NIR3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
AGAP5A6NIR3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGAP5A6NIR3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGAP5A6NIR3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGAP5A6NIR3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGAP5A6NIR3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGAP5A6NIR3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGAP5A6NIR3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGAP5A6NIR3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGAP5A6NIR3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGAP5A6NIR3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGAP5A6NIR3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGAP5A6NIR3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP5A6NIR3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP5A6NIR3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP5A6NIR3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP5A6NIR3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP5A6NIR3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP5A6NIR3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP5A6NIR3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP5A6NIR3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP5A6NIR3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP5A6NIR3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP5A6NIR3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP5A6NIR3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP5A6NIR3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms