Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
VWA3AA6NCI4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VWA3AA6NCI4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
VWA3AA6NCI4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
VWA3AA6NCI4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VWA3AA6NCI4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VWA3AA6NCI4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VWA3AA6NCI4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
VWA3AA6NCI4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
VWA3AA6NCI4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
VWA3AA6NCI4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
VWA3AA6NCI4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VWA3AA6NCI4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
VWA3AA6NCI4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
VWA3AA6NCI4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
VWA3AA6NCI4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
VWA3AA6NCI4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VWA3AA6NCI4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
VWA3AA6NCI4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VWA3AA6NCI4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VWA3AA6NCI4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VWA3AA6NCI4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VWA3AA6NCI4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VWA3AA6NCI4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VWA3AA6NCI4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VWA3AA6NCI4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VWA3AA6NCI4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VWA3AA6NCI4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
VWA3AA6NCI4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VWA3AA6NCI4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VWA3AA6NCI4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
VWA3AA6NCI4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VWA3AA6NCI4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VWA3AA6NCI4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
VWA3AA6NCI4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
VWA3AA6NCI4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VWA3AA6NCI4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VWA3AA6NCI4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VWA3AA6NCI4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VWA3AA6NCI4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VWA3AA6NCI4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
VWA3AA6NCI4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
VWA3AA6NCI4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VWA3AA6NCI4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VWA3AA6NCI4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VWA3AA6NCI4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VWA3AA6NCI4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VWA3AA6NCI4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VWA3AA6NCI4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VWA3AA6NCI4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VWA3AA6NCI4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VWA3AA6NCI4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VWA3AA6NCI4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VWA3AA6NCI4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VWA3AA6NCI4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VWA3AA6NCI4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VWA3AA6NCI4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VWA3AA6NCI4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VWA3AA6NCI4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VWA3AA6NCI4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VWA3AA6NCI4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VWA3AA6NCI4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VWA3AA6NCI4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VWA3AA6NCI4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VWA3AA6NCI4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VWA3AA6NCI4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VWA3AA6NCI4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
VWA3AA6NCI4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VWA3AA6NCI4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VWA3AA6NCI4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VWA3AA6NCI4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VWA3AA6NCI4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VWA3AA6NCI4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VWA3AA6NCI4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VWA3AA6NCI4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VWA3AA6NCI4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VWA3AA6NCI4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VWA3AA6NCI4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VWA3AA6NCI4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VWA3AA6NCI4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VWA3AA6NCI4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
VWA3AA6NCI4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VWA3AA6NCI4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VWA3AA6NCI4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
VWA3AA6NCI4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VWA3AA6NCI4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
VWA3AA6NCI4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VWA3AA6NCI4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
VWA3AA6NCI4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VWA3AA6NCI4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VWA3AA6NCI4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
VWA3AA6NCI4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VWA3AA6NCI4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VWA3AA6NCI4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VWA3AA6NCI4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VWA3AA6NCI4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VWA3AA6NCI4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VWA3AA6NCI4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
VWA3AA6NCI4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VWA3AA6NCI4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms