Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms