Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms