Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms