Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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HDGFL3Q9Y3E1 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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HDGFL3Q9Y3E1 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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HDGFL3Q9Y3E1 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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