Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
ERVW-1Q9UQF0 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms