Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms