Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGXB4Q9UGU5 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms