Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms