Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms