Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms