Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7N4

SCAF1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF1Q9H7N4 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCAF1Q9H7N4 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCAF1Q9H7N4 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCAF1Q9H7N4 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAF1Q9H7N4 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAF1Q9H7N4 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAF1Q9H7N4 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAF1Q9H7N4 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAF1Q9H7N4 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAF1Q9H7N4 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAF1Q9H7N4 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAF1Q9H7N4 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAF1Q9H7N4 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAF1Q9H7N4 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAF1Q9H7N4 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAF1Q9H7N4 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAF1Q9H7N4 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAF1Q9H7N4 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAF1Q9H7N4 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAF1Q9H7N4 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAF1Q9H7N4 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAF1Q9H7N4 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAF1Q9H7N4 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAF1Q9H7N4 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAF1Q9H7N4 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAF1Q9H7N4 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAF1Q9H7N4 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAF1Q9H7N4 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAF1Q9H7N4 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAF1Q9H7N4 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAF1Q9H7N4 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAF1Q9H7N4 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAF1Q9H7N4 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAF1Q9H7N4 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAF1Q9H7N4 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAF1Q9H7N4 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAF1Q9H7N4 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAF1Q9H7N4 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAF1Q9H7N4 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAF1Q9H7N4 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAF1Q9H7N4 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAF1Q9H7N4 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAF1Q9H7N4 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAF1Q9H7N4 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAF1Q9H7N4 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAF1Q9H7N4 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAF1Q9H7N4 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAF1Q9H7N4 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAF1Q9H7N4 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAF1Q9H7N4 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAF1Q9H7N4 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAF1Q9H7N4 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAF1Q9H7N4 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAF1Q9H7N4 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAF1Q9H7N4 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAF1Q9H7N4 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAF1Q9H7N4 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAF1Q9H7N4 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAF1Q9H7N4 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAF1Q9H7N4 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAF1Q9H7N4 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAF1Q9H7N4 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAF1Q9H7N4 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAF1Q9H7N4 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAF1Q9H7N4 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAF1Q9H7N4 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAF1Q9H7N4 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAF1Q9H7N4 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAF1Q9H7N4 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SCAF1Q9H7N4 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SCAF1Q9H7N4 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SCAF1Q9H7N4 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SCAF1Q9H7N4 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SCAF1Q9H7N4 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCAF1Q9H7N4 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCAF1Q9H7N4 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCAF1Q9H7N4 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCAF1Q9H7N4 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCAF1Q9H7N4 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCAF1Q9H7N4 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCAF1Q9H7N4 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SCAF1Q9H7N4 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCAF1Q9H7N4 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SCAF1Q9H7N4 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCAF1Q9H7N4 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCAF1Q9H7N4 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SCAF1Q9H7N4 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCAF1Q9H7N4 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCAF1Q9H7N4 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCAF1Q9H7N4 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCAF1Q9H7N4 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCAF1Q9H7N4 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCAF1Q9H7N4 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCAF1Q9H7N4 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCAF1Q9H7N4 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCAF1Q9H7N4 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCAF1Q9H7N4 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCAF1Q9H7N4 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCAF1Q9H7N4 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCAF1Q9H7N4 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms