Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms