Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms