Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms