Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms