Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVN2

RUSC1, RUN and SH3 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUSC1Q9BVN2 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUSC1Q9BVN2 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms