Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM43Q9BTV4 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms