Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC21.32■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC21.32■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC21.32■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC21.31■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC21.31■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC21.31■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC21.31■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC21.31■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC21.3■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC21.3■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC21.29■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC21.29■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms