Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms