Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms