Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC11.07□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC11.07□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC11.07□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms