Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms