Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms