Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms