Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTF1AQ7RTS3 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTF1AQ7RTS3 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTF1AQ7RTS3 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTF1AQ7RTS3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTF1AQ7RTS3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTF1AQ7RTS3 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTF1AQ7RTS3 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTF1AQ7RTS3 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTF1AQ7RTS3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms