Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP34Q70CQ2 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP34Q70CQ2 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
USP34Q70CQ2 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP34Q70CQ2 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP34Q70CQ2 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP34Q70CQ2 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP34Q70CQ2 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP34Q70CQ2 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP34Q70CQ2 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP34Q70CQ2 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP34Q70CQ2 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
USP34Q70CQ2 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP34Q70CQ2 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP34Q70CQ2 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP34Q70CQ2 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
USP34Q70CQ2 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
USP34Q70CQ2 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
USP34Q70CQ2 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
USP34Q70CQ2 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
USP34Q70CQ2 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
USP34Q70CQ2 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
USP34Q70CQ2 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
USP34Q70CQ2 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
USP34Q70CQ2 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
USP34Q70CQ2 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
USP34Q70CQ2 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
USP34Q70CQ2 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
USP34Q70CQ2 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
USP34Q70CQ2 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
USP34Q70CQ2 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
USP34Q70CQ2 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
USP34Q70CQ2 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
USP34Q70CQ2 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
USP34Q70CQ2 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
USP34Q70CQ2 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
USP34Q70CQ2 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
USP34Q70CQ2 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
USP34Q70CQ2 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP34Q70CQ2 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP34Q70CQ2 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP34Q70CQ2 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP34Q70CQ2 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP34Q70CQ2 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
USP34Q70CQ2 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP34Q70CQ2 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP34Q70CQ2 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP34Q70CQ2 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP34Q70CQ2 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
USP34Q70CQ2 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
USP34Q70CQ2 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP34Q70CQ2 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP34Q70CQ2 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP34Q70CQ2 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP34Q70CQ2 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP34Q70CQ2 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP34Q70CQ2 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP34Q70CQ2 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP34Q70CQ2 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP34Q70CQ2 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP34Q70CQ2 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP34Q70CQ2 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP34Q70CQ2 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP34Q70CQ2 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP34Q70CQ2 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP34Q70CQ2 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP34Q70CQ2 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP34Q70CQ2 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP34Q70CQ2 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP34Q70CQ2 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
USP34Q70CQ2 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP34Q70CQ2 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
USP34Q70CQ2 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP34Q70CQ2 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP34Q70CQ2 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP34Q70CQ2 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP34Q70CQ2 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP34Q70CQ2 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP34Q70CQ2 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP34Q70CQ2 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP34Q70CQ2 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP34Q70CQ2 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP34Q70CQ2 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP34Q70CQ2 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP34Q70CQ2 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP34Q70CQ2 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP34Q70CQ2 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP34Q70CQ2 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP34Q70CQ2 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP34Q70CQ2 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP34Q70CQ2 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP34Q70CQ2 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP34Q70CQ2 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP34Q70CQ2 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP34Q70CQ2 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP34Q70CQ2 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP34Q70CQ2 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP34Q70CQ2 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP34Q70CQ2 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP34Q70CQ2 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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