Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms