Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms